La température de stérilisation par micro-ondes est de 65°C à 85°C, la durée est de 3 à 5 minutes. Les effets thermiques des micro-ondes modifient la protéine bactérienne, la font perdre ses nutriments, ses conditions de reproduction et de survie, et entraînent la mort. Le champ électromagnétique des micro-ondes peut rendre la croissance normale et la stabilité de l'acide nucléique des bactéries [ARN] et de l'acide désoxyribonucléique [ADN] plus lâches, provoquer des cassures et des recombinaisons, induisant ainsi des mutations génétiques, des aberrations chromosomiques et même des ruptures.
